Історія кафедри починається з організації у вересні 1916 року кафедри загальної хімії, якою керував доцент гірничого інституту Чумаков С.М. до 1934 року. У 1917 році була створена самостійна кафедра аналітичної хімії під керівництвом професора Писаржевського Л.В.
Організація кафедри біологічної хімії відбулась у 1917-18 навчальному році.
Її першим завідувачем став професор Архангельський В.М. У 1982-83 навчальному році відбулось об’єднання кафедр біологічної та органічної хімії. Її завідувачем стала професор Мозгова Є.М. Пізніше приєдналась кафедра біонеорганічної хімії. Таким чином, шляхом послідовних об'єднань, була створена єдина кафедра під загальною назвою біологічної та загальної хімії. Її завідувачем до 1996 року був професор Бачинський П.П., а з 1996 і до теперішнього часу – професор Бразалук О.З.
У зв'язку зі створенням на базі медакадемії фармацевтичного факультету з 2001 року на кафедрі здійснюється викладання фармацевтичної хімії, тому зараз вона має назву – кафедра біохімії, медичної та фармацевтичної хімії.